Hongos hipógeos: son los que tienen cuerpos reproductivos que forman y completan la maduración de sus esporas debajo del suelo (enterrados), no suelen presentar orificios externos para la dispersión de sus esporas, sino que estas no son liberadas hasta que el cuerpo fructífero se degrada, rompiéndose la envoltura externa o una vez que son con sumidos por animales.

• Ascomycota
• Basidiomycota
• Glomeromycota
• Zygomycota